Der Fachbereich Wirtschaftsingenieurwesen der Ernst-Abbe-Hochschule Jena bietet den berufsbegleitenden Masterstudiengang Wirtschaftsingenieurwesen für im Beruf stehende Wirtschaftsingenieure oder Ingenieure an, die sich auf Management- und komplexe Koordinationsaufgaben vorbereiten möchten. Er wird dabei von JenALL e. V., der gemeinsamen Weiterbildungsakademie der Friedrich-Schiller-Universität und der Ernst-Abbe-Hochschule Jena, administrativ unterstützt.
Das Ziel des fünfsemestrigen Studienganges ist es, wissenschaftliche und praxisnahe Kenntnisse und Kompetenzen zu vermitteln, um Wertschöpfungs- und Prozessketten in Industrie- und Dienstleistungsunternehmen zu beherrschen und zu gestalten.